ATM

Науково-освітній інтернет-портал ІЕПОР ім. Р.Є.Кавецького НАН України

Первинна профілактика, діагностика і лікування хворих на рак молочної залози

Сьогодні: 26.09.2017

Ген ATM

Опис гена

  • Назва гена:

    ATM

  • Повна назва гена:

    Телеангіоектатична атаксiя мутована / Ataxia telangiectasia mutated

  • Синонім назви гена:

    AT1; ATA; ATC; ATD; ATE; ATDC; TEL1; TELO1; MGC74674; DKFZp781A0353; ATM

  • Хромосома:Цитобенд: 11q22-q23
  • Локалізація на хромосомі (Bp): 108093211-108239829
  • Кількість варіантів сплайсінгу: 25
  • Опис гена і білка:

    Білок, що кодується цим геном, належить до сімейства PI3/PI4-кіназ. Цей білок є важливою кіназою контрольної точки клітинного циклу, що фосфорилює; таким чином, він функціонує як регулятор широкого спектру каскаду білків, у тому числі білків – супресорів пухлин p53 і BRCA1, кіназою контрольної точки клітинного циклу Chk2, білків кіназою контрольної точки клітинного циклу RAD17 і RAD9, і білка репарації ДНК NBS1. Цей білок і тісно пов'язана з ним кіназа ATR вважаються центральними регуляторами сигнальних шляхів контрольної точки клітинного циклу, необхідними для клітинної відповіді на пошкодження ДНК і задля стабільності геному. Мутації в цьому гені асоціюються з телеангіоектатичною атаксiєю, яка належить до аутосомно-рецесивних розладів. Були виявлені два варіанти транскриптів цього гена, що кодують різні ізоформи.

  • Тип гена:

    Kодування білка

  • Клас генів: Онкоген
  • Пенетрантність у проявленні онкологічних захворювань: Високопенетрантний ген
  • Організм: Homo sapiens

Опис білка

  • Назва білка:

    Серин-протеїнкіназа ATM (ЄС 2.7.11.1) (Телеангіоектатична атаксiя мутована) (AT, мутована)

  • Субклітинна локалізація:

    Ядро. Цитоплазматичний везикул. Примітка: Міститься головним чином у ядрі. Виявляється також у ендоцитотичних везикулах, що перебувають у зв’язку  з бета-адаптином.

  • Функції білка:

    Серін / треонін-протеїнкіназа активує сигналізацію контрольних точок при подвійних розривах ДНК (DSBs), апоптозі та генотоксичних стресах, таких як іонізуюче ультрафіолетове світло А (UVA), тим самим виступаючи як датчик пошкодження ДНК. Розпізнає консенсусну послідовність субстрату [ST]-Q. Фосфорилює 'Ser-139' варіанта гістону H2AX/H2AFX у подвійних розривах ДНК (DSB), тим самим регулюючи механізм реагування на пошкодження ДНК. Також він бере участь у трансдукції сигналу і контролі клітинного циклу. Може функціонувати як супресор пухлини. Необхідна для активації ABL1 та SAPK. Фосфорилює p53/TP53, FANCD2, NFKBIA, BRCA1, CTIP, nibrin (NBN), TERF1, RAD9 та DCLRE1C. Може відігравати роль у транспортуванні везикул і/або білків. Може відігравати роль у розвитку Т-клітин, статевих залоз і неврологічних функцій. Зв'язує кінці ДНК.

  • Імуногістохімічна характеристика:
  • Структура субодиниць:

    Димери або тетрамери в неактивному стані. При пошкодженні ДНК АТМ дисоціює шляхом автофосфорилювання на мономери, внаслідок чого вони стають каталітично активними. Зв'язується з p53/TP53, ABL1, BRCA1, NBN/nibrin та TERF1. Входить до складу BRCA1-асоційованого комплексу геномного нагляду (BASC), що містить BRCA1, MSH2, MSH6, MLH1, ATM, BLM, PMS2 та комплекс білків RAD50-MRE11-NBN. Ця асоціація може виявлятися  як динамічний процес, що змінюється протягом усього клітинного циклу і в межах суб'ядерних доменів. Взаємодіє з RAD17; пошкодження ДНК запускає асоціацію. Взаємодіє з EEF1E1;, індукована пошкодженням ДНК взаємодія активує TP53. Взаємодіє з DCLRE1C, MYST1, KAT5, OBFC2B, ATMIN та CEP164. Взаємодіє з AP2B1 і AP3B2; взаємодія відбувається в цитоплазматичних везикулах

  • Каталітична активність :

    ATP + білок = ADP + фосфопротеїн.

  • Регуляція ферментативної активності:

    Інгібується вортманіном.

  • Доменна структура:

    Для взаємодії з KAT5 потрібен домен FATC.

  • Тканинна специфічність:

    Виявлено в підшлунковій залозі, нирках, скелетних м'язах, печінці, легенях, плаценті, головному мозку, серці, селезінці, вилочковій залозі, сім'яниках, яєчниках, тонкій кишці, товстій кишці та лейкоцитах.

  • Посттрансляційна модифікація:

    Фосфорилюється NUAK1/ARK5. Автофосфорилювання на Ser-367, Ser-1983, Сер-1981 корелює з опосередкованим пошкодженням ДНК активацією кінази.

    Ацетилювання при пошкодженні ДНК потрібне для активації кінази, переходу димер-мономер і подальшого аутофосфорилювання на Ser-1981. Ацетилюється in vitro KAT5/TIP60.

  • Індукція:

    Іонізуючим випромінюванням.

  • Література:

    1. "The ATM gene and susceptibility to breast cancer: analysis of 38 breast tumors reveals no evidence for mutation."
    Vorechovsky I., Rasio D., Luo L., Monaco C., Hammarstroem L., Webster A.D.B., Zaloudik J., Barbanti-Brodano G., James M.R., Russo G., Croce C.M., Negrini M. Cancer Res. 56:2726-2732(1996) [PubMed] [Europe PMC] [Abstract].

    2. "BASC, a super complex of BRCA1-associated proteins involved in the recognition and repair of aberrant DNA structures."
    Wang Y., Cortez D., Yazdi P., Neff N., Elledge S.J., Qin J. Genes Dev. 14:927-939(2000) [PubMed] [Europe PMC] [Abstract].

    3. "Functional link of BRCA1 and ataxia telangiectasia gene product in DNA damage response."
    Li S., Ting N.S.Y., Zheng L., Chen P.-L., Ziv Y., Shiloh Y., Lee E.Y.-H.P., Lee W.-H. Nature 406:210-215(2000) [PubMed] [Europe PMC] [Abstract].

    4. "ATM mutations in cancer families."
    Vorechovsky I., Luo L., Lindblom A., Negrini M., Webster A.D.B., Croce C.M., Hammarstroem L. Cancer Res. 56:4130-4133(1996) [PubMed] [Europe PMC] [Abstract].

    5. "Patterns of somatic mutation in human cancer genomes."
    Greenman C., Stephens P., Smith R., Dalgliesh G.L., Hunter C., Bignell G., Davies H., Teague J., Butler A., Stevens C., Edkins S., O'Meara S., Vastrik I., Schmidt E.E., Avis T., Barthorpe S., Bhamra G., Buck G. expand/collapse author list Stratton M.R. Nature 446:153-158(2007) [PubMed] [Europe PMC] [Abstract]

Опис транскриптів

Назва транскрипта ID транскрипта в БД Ensembl Довжина (bp) ID білка в БД Ensembl Довжина (aa) Біотип
ATM-001 ENST00000527805 4841 ENSP00000435747 1369 Protein coding
ATM-002 ENST00000530958 5718 No protein product - Retained intron
ATM-003 ENST00000452508 12954 ENSP00000388058 3056 Protein coding
ATM-004 ENST00000526567 560 No protein product - Retained intron
ATM-005 ENST00000525012 258 No protein product - Processed transcript
ATM-006 ENST00000533526 234 No protein product - Processed transcript
ATM-009 ENST00000419286 305 No protein product - Processed transcript
ATM-010 ENST00000533733 1731 No protein product - Retained intron
ATM-011 ENST00000524792 5912 No protein product - Retained intron
ATM-012 ENST00000531525 1513 ENSP00000434327 155 Protein coding
ATM-014 ENST00000529588 502 ENSP00000435524 77 Nonsense mediated decay
ATM-015 ENST00000533690 3354 No protein product - Retained intron
ATM-016 ENST00000532931 481 ENSP00000432318 93 Protein coding
ATM-017 ENST00000531957 537 No protein product - Retained intron
ATM-018 ENST00000534625 725 No protein product - Retained intron
ATM-019 ENST00000532765 610 No protein product - Processed transcript
ATM-020 ENST00000525537 586 No protein product - Retained intron
ATM-021 ENST00000527389 402 No protein product - Retained intron
ATM-022 ENST00000525056 657 No protein product - Retained intron
ATM-023 ENST00000525178 880 No protein product - Processed transcript
ATM-024 ENST00000527181 740 No protein product - Retained intron
ATM-025 ENST00000533979 705 No protein product - Processed transcript
ATM-026 ENST00000527891 595 ENSP00000433955 154 Protein coding
ATM-027 ENST00000601453 582 ENSP00000469471 135 Protein coding
ATM-201 ENST00000278616 13147 ENSP00000278616 3056 Protein coding
Детальніше в цій категорії: PGR »
Ви тут: Home