Ген BRIP1
Опис гена
-
Назва гена:
BRIP1
-
Повна назва гена:
BRCA1 interacting protein C-terminal helicase 1
-
Синонім назви гена:
BACH1, FANCJ
- Хромосома:Цитобенд: 17:q23.2
- Локалізація на хромосомі (Bp): 59758627 - 59940882
- Кількість варіантів сплайсінгу: 6
-
Опис гена і білка:
Білок, що кодується цим геном, є членом сімейства білків RecQ DEAH гелікази і взаємодіє з BRCT повторами типу 1 (BRCA1) у клітинах раку молочної залози. Зв'язаний комплекс відіграє важливу роль у нормальній функції репарації дволанцюжкових розривів типу 1 (BRCA1) у клітинах раку молочної залози. Цей ген може бути мішенню генеративних мутацій, що викликають рак.
-
Тип гена:
Кодування білка
- Клас генів: Онкоген
- Пенетрантність у проявленні онкологічних захворювань: Низькопенетрантний ген
- Організм: Homo sapiens
- NCBI Entrez Gene
- Бібліотеки генів та білків: UniProtKB
- Ensemble
- The human protein atlas
Опис білка
-
Назва білка:
Білок групи J при анемії Фанконі
-
Субклітинна локалізація:
Ядро.
-
Функції білка:
ДНК-залежна АТФ-аза та 5'–3' ДНК геліказа, необхідна для підтримання стабільності хромосом. Діє в кінці шляху анемії Фанконі, після убіквітинування FANCD2. Участь у репарації дволанцюжкових розривів шляхом гомологічної рекомбінації в спосіб, який залежить від його зв'язку з BRCA1.
- Імуногістохімічна характеристика:
-
Структура субодиниць:
Зв'язується безпосередньо з доменами BRCT в BRCA1
-
Каталітична активність :
АТФ + H2O = АДФ + фосфатаза.
-
Кофактори:
Зв'язується з кластером 1 4Fe-4S.
-
Доменна структура:
Для активності гелікази потрібне зв'язування із залізом і сіркою 4Fe-4S.
-
Тканинна специфічність:
Має широку експресію в різних тканинах, але найвищих рівнів експресія досягає в яєчках.
-
Посттрансляційна модифікація:
Фосфорильованний. Фосфорилювання необхідне для взаємодії з BRCA1 і регулюється клітинним циклом. Ацетилювання в Lys-1249 полегшує кінцевий процесинг ДНК, необхідний для репарації та сигналізації контрольних точок.
-
Участь у розвитку захворювань:
Рак молочної залози (РМЗ): поширене злоякісне утворення, що походить з епітеліальної тканини молочної залози. Новоутворення молочної залози можна розрізнити за їх гістологією. Інвазивний протоковий рак є найбільш поширеним типом. Рак молочної залози є етіологічно і генетично неоднорідним. Аналіз родоводів і частоти двостороннього захворювання дозволив виявити важливі генетичні фактори. Мутації в більш ніж одиного локусу можуть бути залучені в різних сім'ях або навіть в одному й тому самому випадку.
-
Схожість послідовнестей:
Належить до сімейства геліказ DEAD box. Підсімейство DEAH. Містить 1 хеліказний АТФ-зв'язуючий домен.
-
Література:
1. Loss of the BRCA1-interacting helicase BRIP1 results in abnormal mammary acinar morphogenesis. Daino K, et al. PLoS One, 2013. PMID 24040146, Free PMC Article
2. Association between BRIP1 (BACH1) polymorphisms and breast cancer risk: a meta-analysis. Pabalan N, et al. Breast Cancer Res Treat, 2013 Jan. PMID 23225146
3. Mutation analysis of BRIP1 in male breast cancer cases: a population-based study in Central Italy.Silvestri V, Rizzolo P, Falchetti M, Zanna I, Masala G, Bianchi S, Palli D, Ottini L. Breast Cancer Res Treat. 2011 Apr;126(2):539-43. doi: 10.1007/s10549-010-1289-x. Epub 2010 Dec 17.
4. A novel breast cancer-associated BRIP1 (FANCJ/BACH1) germ-line mutation impairs protein stability and function. De Nicolo A, Tancredi M, Lombardi G, Flemma CC, Barbuti S, Di Cristofano C, Sobhian B, Bevilacqua G, Drapkin R, Caligo MA. Clin Cancer Res. 2008 Jul 15;14(14):4672-80.
5. Mutation analysis of BRIP1/BACH1 in BRCA1/BRCA2 negative Chinese women with early onset breast cancer or affected relatives. Cao AY, Huang J, Hu Z, Li WF, Ma ZL, Tang LL, Zhang B, Su FX, Zhou J, Di GH, Shen KW, Wu J, Lu JS, Luo JM, Yuan WT, Shen ZZ, Huang W, Shao ZM. Breast Cancer Res Treat. 2009 May;115(1):51-5.
6. Mutational analysis of the breast cancer susceptibility gene BRIP1 /BACH1/FANCJ in high-risk non-BRCA1/BRCA2 breast cancer families. Guénard F, Labrie Y, Ouellette G, Joly Beauparlant C, Simard J, Durocher F; INHERIT BRCAs. J Hum Genet. 2008;53(7):579-91.
7. BRIP1 (BACH1) variants and familial breast cancer risk: a case-control study.Frank B, Hemminki K, Meindl A, Wappenschmidt B, Sutter C, Kiechle M, Bugert P, Schmutzler RK, Bartram CR, Burwinkel B.BMC Cancer. 2007 May 15;7:83.
8. Tagging single nucleotide polymorphisms in the BRIP1 gene and susceptibility to breast and ovarian cancer.Song H, Ramus SJ, Kjaer SK, Hogdall E, Dicioccio RA, Whittemore AS, McGuire V, Hogdall C, Jacobs IJ, Easton DF, Ponder BA, Dunning AM, Gayther SA, Pharoah PD.PLoS One. 2007 Mar 7;2(3):e268.
9. Truncating mutations in the Fanconi anemia J gene BRIP1 are low-penetrance breast cancer susceptibility alleles. Seal S, Thompson D, Renwick A, Elliott A, Kelly P, Barfoot R, Chagtai T, Jayatilake H, Ahmed M, Spanova K, North B, McGuffog L, Evans DG, Eccles D; Breast Cancer Susceptibility Collaboration (UK), Easton DF, Stratton MR, Rahman N. Nat Genet. 2006 Nov;38(11):1239-41.
10. BACH1 Ser919Pro variant and breast cancer risk. Vahteristo P, Yliannala K, Tamminen A, Eerola H, Blomqvist C, Nevanlinna H.BMC Cancer. 2006 Jan 24;6:19.
11. Analysis of the DNA substrate specificity of the human BACH1 helicase associated with breast cancer.Gupta R, Sharma S, Sommers JA, Jin Z, Cantor SB, Brosh RM Jr.J Biol Chem. 2005 Jul 8;280(27):25450-60. Epub 2005 May 5.
12. No evidence of involvement of germline BACH1 mutations in Finnish breast and ovarian cancer families. Karppinen SM, Vuosku J, Heikkinen K, Allinen M, Winqvist R. Eur J Cancer. 2003 Feb;39(3):366-71.
13. No mutations in the BACH1 gene in BRCA1 and BRCA2 negative breast-cancer families linked to 17q22. Luo L, Lei H, Du Q, von Wachenfeldt A, Kockum I, Luthman H, Vorechovsky I, Lindblom A. Int J Cancer. 2002 Apr 1;98(4):638-9.
14. Screening for large genomic rearrangements of the BRIP1 and CHK1 genes in Finnish breast cancer families. Solyom S, Pylkäs K, Winqvist R. Fam Cancer. 2010 Dec;9(4):537-40.
15. Kinetic analysis of interaction of BRCA1 tandem breast cancer c-terminal domains with phosphorylated peptides reveals two binding conformations. Nominé Y, Botuyan MV, Bajzer Z, Owen WG, Caride AJ, Wasielewski E, Mer G. Biochemistry. 2008 Sep 16;47(37):9866-79.
16. Expression of the BRCA1-interacting protein Brip1/BACH1/FANCJ is driven by E2F and correlates with human breast cancer malignancy. Eelen G, Vanden Bempt I, Verlinden L, Drijkoningen M, Smeets A, Neven P, Christiaens MR, Marchal K, Bouillon R, Verstuyf A. Oncogene. 2008 Jul 10;27(30):4233-41.
17. Mutational analysis of the BRCA1-interacting genes ZNF350/ZBRK1 and BRIP1/BACH1 among BRCA1 and BRCA2-negative probands from breast-ovarian cancer families and among early-onset breast cancer cases and reference individuals.Rutter JL, Smith AM, Dávila MR, Sigurdson AJ, Giusti RM, Pineda MA, Doody MM, Tucker MA, Greene MH, Zhang J, Struewing JP. Hum Mutat. 2003 Aug;22(2):121-8.
18. BRIP1, PALB2, and RAD51C mutation analysis reveals their relative importance as genetic susceptibility factors for breast cancer. Wong MW, Nordfors C, Mossman D, Pecenpetelovska G, Avery-Kiejda KA, Talseth-Palmer B, Bowden NA, Scott RJ. Breast Cancer Res Treat. 2011 Jun;127(3):853-9.
19. Evaluation of variants in the CHEK2, BRIP1 and PALB2 genes in an Irish breast cancer cohort.McInerney NM, Miller N, Rowan A, Colleran G, Barclay E, Curran C, Kerin MJ, Tomlinson IP, Sawyer E. Breast Cancer Res Treat. 2010 May;121(1):203-10. doi: 10.1007/s10549-009-0540-9. Epub 2009 Sep 18. Erratum in: Breast Cancer Res Treat. 2012 Jan;131(2):729.
20. Lack of large genomic deletions in BRIP1, PALB2, and FANCD2 genes in BRCA1/2 negative familial breast cancer. Ameziane N, van den Ouweland AM, Adank MA, Vijzelaar RN, Errami A, Dorsman JC, Joenje H, Meijers-Heijboer H, Waisfisz Q. Breast Cancer Res Treat. 2009 Dec;118(3):651-3. doi: 10.1007/s10549-009-0428-8. Epub 2009 Jun 6.
21. Polymorphisms in BRCA1, BRCA1-interacting genes and susceptibility of breast cancer in Chinese women. Huo X, Lu C, Huang X, Hu Z, Jin G, Ma H, Wang X, Qin J, Wang X, Shen H, Tang J. J Cancer Res Clin Oncol. 2009 Nov;135(11):1569-75. doi: 10.1007/s00432-009-0604-6. Epub 2009 May 31.
22. Recruitment of fanconi anemia and breast cancer proteins to DNA damage sites is differentially governed by replication. Shen X, Do H, Li Y, Chung WH, Tomasz M, de Winter JP, Xia B, Elledge SJ, Wang W, Li L. Mol Cell. 2009 Sep 11;35(5):716-23.
23. Kin-cohort estimates for familial breast cancer risk in relation to variants in DNA base excision repair, BRCA1 interacting and growth factor genes.Sigurdson AJ, Hauptmann M, Chatterjee N, Alexander BH, Doody MM, Rutter JL, Struewing JP. BMC Cancer. 2004 Mar 12;4:9.
24. Screening for BRCA1, BRCA2, CHEK2, PALB2, BRIP1, RAD50, and CDH1 mutations in high-risk Finnish BRCA1/2-founder mutation-negative breast and/or ovarian cancer individuals. Kuusisto KM, Bebel A, Vihinen M, Schleutker J, Sallinen SL. Breast Cancer Res. 2011 Feb 28;13(1):R20.
25. Polymorphisms in DNA double-strand break repair genes and risk of breast cancer: two population-based studies in USA and Poland, and meta-analyses. García-Closas M, Egan KM, Newcomb PA, Brinton LA, Titus-Ernstoff L, Chanock S, Welch R, Lissowska J, Peplonska B, Szeszenia-Dabrowska N, Zatonski W, Bardin-Mikolajczak A, Struewing JP. Hum Genet. 2006 May;119(4):376-88.
26. The Fanconi anemia family of genes and its correlation with breast cancer susceptibility and breast cancer features. Barroso E, Pita G, Arias JI, Menendez P, Zamora P, Blanco M, Benitez J, Ribas G. Breast Cancer Res Treat. 2009 Dec;118(3):655-60.