KDM7A

Науково-освітній інтернет-портал ІЕПОР ім. Р.Є.Кавецького НАН України

Первинна профілактика, діагностика і лікування хворих на рак молочної залози

Сьогодні: 26.09.2017

Ген KDM7A

Опис гена

  • Назва гена:

    KDM7A

  • Повна назва гена:

    lysine (K)-specific demethylase 7A

  • Синонім назви гена:

    KDM7, KIAA1718, JHDM1D

  • Хромосома:Цитобенд: 7:q34
  • Локалізація на хромосомі (Bp): 140,177,261-140,179,640
  • Кількість варіантів сплайсінгу: 1
  • Опис гена і білка:

    Деметилази гістонів необхідна для розвитку головного мозку. Специфічно деметилює диметильовані «Lys-9» і «Lys-27» (H3K9me2 і H3K27me2 відповідно) гістону Н3 і монометильований залишок «Lys-20» гістону Н4 (H4K20Me1) і в такий спосіб відіграє центральну роль у коді гістону. Специфічно зв'язується з триметильованим залишком «Lys-4» гістону Н3 (H3K4me3), впливаючи на специфічність деметилази гістонів: у присутності H3K4me3 вона не демонструє деметилазної активності щодо H3K9me2, при цьому вона демонструє високу активність по відношенню до H3K27me2. Деметилює H3K9me2 за відсутності H3K4me3. Виявляє активність щодо H4K20Me1 тільки тоді, коли нуклеосома використовується як субстрат, а також  коли як субстрат використовується не октамер гістону.

  • Тип гена:

    кодування білка

  • Організм: Homo sapiens

Опис білка

  • Назва білка:

    Лізин (К)-специфічна деметилаза 7A (lysine (K)-specific demethylase 7A)

  • Субклітинна локалізація:

    Ядро

  • Функції білка:

    Деметилаза гістонів необхідна для розвитку головного мозку. Специфічно деметилює диметильовані «Lys-9» і «Lys-27» (H3K9me2 і H3K27me2 відповідно) гістону Н3 і монометильований залишок «Lys-20» гістону Н4 (H4K20Me1) і в такий спосіб відіграє центральну роль у коді гістону. Специфічно зв'язується з триметильованим залишком «Lys-4» гістону Н3 (H3K4me3), впливаючи на специфічність деметилази гістонів: у присутності H3K4me3 вона не демонструє деметилазної активності щодо H3K9me2, при цьому вона демонструє високу активність по відношенню до H3K27me2. Деметилює H3K9me2 за відсутності H3K4me3. Виявляє активність щодо H4K20Me1 тільки тоді, коли нуклеосома використовується як субстрат, а також коли як субстрат використовується не октамер гістону.

  • Імуногістохімічна характеристика:
  • Кофактори:

    Fe2+. Примітка: Зв'язується з 1 іоном Fe2+ на субодиницю.

  • Доменна структура:

    Цинковий палець PHD-типу опосередковує зв'язування з H3K4me3. Зв'язування з H3K4me3 запобігає його доступу до H3K9me2. Лінкерний регіон є критичним фактором специфічності деметилази. Це не дає змоги активному сайта JmjC досягти цільового H3K9me2, коли цинковий палець PHD-типу зв'язується з H3K4me3, в той час як він сприяє селективності по відношенню до H3K27me2.

  • Додаткова інформація:

    Належить до сімейства деметилази гістонів JHDM1. Підсімейство JHDM1D. Містить 1 домен JmjC. Містить 1 цинковий палець PHD-типу.

  • Література:

    1. Increased expression of histone demethylase JHDM1D under nutrient starvation suppresses tumor growth via down-regulating angiogenesis. Osawa T, Muramatsu M, Wang F, Tsuchida R, Kodama T, Minami T, Shibuya M. Proc Natl Acad Sci U S A. 2011 Dec 20;108(51):20725-9. doi: 10.1073/pnas.1108462109. Epub 2011 Dec 5.

Ви тут: Home